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            科研動(dòng)態(tài)

            陜西省西安植物園在木本油料樹(shù)種核桃抗冷研究方面取得新進(jìn)展

            來(lái)源: 時(shí)間:2023-12-20

                     近日,陜西省科學(xué)院西安植物園周惠娟博士以第一作者身份在植物分子學(xué)術(shù)期刊《International journal of molecular science》(IF=5.6,中科院二區top)在線(xiàn)發(fā)表了題為“Genome-wide identification of the CBF gene family and ICE transcription factors in walnuts and expression profiles under cold conditions” 的研究論文。

              核桃(Juglans regia,2n=32)隸屬于胡桃科胡桃屬,自然分布于歐亞大陸,為重要的木本經(jīng)濟樹(shù)種,在全球廣泛栽培。核桃也稱(chēng)胡桃,波斯核桃(Persian walnut),其果實(shí)油脂蛋白含量高且營(yíng)養豐富是重要的木本油料經(jīng)濟樹(shù)種。冷脅迫對樹(shù)木生長(cháng)及產(chǎn)量有重要影響,尤其是晚春的溫度驟降嚴重制約果樹(shù)產(chǎn)量。

                 

              圖1 不同核桃品種抗冷轉錄因子CBF和ICE基因家族分析

              該研究利用“倒春寒”前后溫度驟降時(shí)期,樣品不同組織轉錄組測序,以核桃全基因組為參考,對不同核桃品種進(jìn)行了抗冷模塊CBF-ICE1-COR的生物信息學(xué)分析。包括轉錄因子數目、基因家族保守結構域、染色體定位、系統進(jìn)化關(guān)系、保守基序、順式調控元件和蛋白理化性質(zhì)以及基因共線(xiàn)性等分析,發(fā)現三個(gè)核桃樣品在基因家族數目、染色體分布等均存在差異。通過(guò)不同溫度條件下轉錄組數據分析,發(fā)現ICE基因的表達量明顯高于CBF基因,且在不同的品種中,其表達模式存在顯著(zhù)差異。

                

              圖2 不同溫度條件下CBF和ICE基因表達模式分析

              除此之外,該研究還對CBF和ICE基因進(jìn)行了蛋白互作關(guān)系以及miRNA調控預測,且預測的miRNA在擬南芥中已被證明與寒冷、干旱、鹽脅迫等非生物脅迫相關(guān)。該研究對于抗冷核桃品種選育以及分子育種提供了一定的理論意義。

               

              圖3 抗冷轉錄因子CBF和ICE蛋白互作關(guān)系分析

              我園周惠娟博士為論文第一作者,陜西省西安植物園為第一完成單位。該研究得到了陜西省科學(xué)院項目(2023K-26, 2023K-49)和陜西省林業(yè)科學(xué)研究院科技研發(fā)重點(diǎn)專(zhuān)項(SXLK2023-02-20)以及國家自然科學(xué)基金 (32370386, 32070372, 32200295)等項目的資助。

              文章鏈接:https://www.mdpi.com/1422-0067/25/1/25/html

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