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            科研動(dòng)態(tài)
            
							
            
								
            陜西省西安植物園（陜西省植物研究所）在化香樹(shù)基因組學(xué)研究方面取得新進(jìn)展
            
								
            
									來(lái)源：
									時(shí)間：2024-05-09
								
            
								
            　　       近日，陜西省西安植物園周惠娟博士以第一作者身份在學(xué)術(shù)期刊《Scientific Data》（IF=9.8003，JCR: Q1）在線(xiàn)發(fā)表了題為“Chromosome-level genome assembly of Platycarya strobilacea” 的研究論文。
            　　化香樹(shù)（Platycarya strobilacea）隸屬于胡桃科化香樹(shù)屬，為東亞地區特有種，廣泛分布于中國、韓國、日本以及越南地區，具有重要的生態(tài)價(jià)值，可用于園林綠化，以及清熱解毒、抗氧化等藥用價(jià)值。本研究利用二代測序、三代測序、Hi-C測序、不同組織三代全轉錄組學(xué)及二代轉錄組學(xué)測序組裝提升并得到了化香樹(shù)的高質(zhì)量染色體水平基因組。全基因組大小為677.30 Mb，共注釋得到32,246個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，scaffold N50值為43.67 Mb，98.43%成功掛載到了15條染色體上。該研究結果可為被子植物及胡桃科植物系統進(jìn)化和比較基因組學(xué)研究提供重要的數據基礎。
            圖1 化香樹(shù)形態(tài)和染色體水平基因組特征
            　　我園周惠娟博士為論文第一作者，陜西省西安植物園為第一完成單位。該研究得到了陜西省科學(xué)院項目（2023K-26, 2023K-49），陜西省林業(yè)科學(xué)研究院科技研發(fā)重點(diǎn)專(zhuān)項（SXLK2023-02-20）和國家自然科學(xué)基金（32370386, 32070372, 32200295）等項目的資助。
            　　原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41597-024-03107-4
            
								
            
							
            
							
            
								
            
									
            
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